沈阳市数字农业工程研究中心于2009年经市发改委批准设立，依托于全国农村经济信息网沈阳工作站（沈阳市发改委农信站）。
农信站成立于1995年，以建设和完善农村区域公共信息服务平台和农业信息化技术研发平台为发展目标。1997年在沈阳市率先建立“沈阳农村经济信息网”，从而奠定了农信站发展的基础。
从1998年开始，农信站先后承担了中日信息化合作项目-沈阳农业信息系统、农业信息资源整合与共享平台等国家高技术产业项目的开发，其中中日信息化合作项目-沈阳农业信息系统在2005年被国家发改委确定为“国家高技术产业化示范工程”。
2008年5月，市发改委与市农委联合下发了《关于开放公共服务平台服务农村信息网站建设的通知》，依托农信站的网络资源优势和技术平台优势，建立沈阳市农村信息化公共服务平台，免费向辽沈地区广大农村开放。同时开发设立了平台公共服务站点（www.02412316.com）。2012年以平台为基础启动沈阳市农村信息化“千村E网”工程。竭诚为我市农村政府、企业和农户服务。农信站拥有60多部网络信息服务器和专业信息服务器，100TB的存储区域网络(SAN)系统、专业的数据备份系统和千兆光纤网络系统的数据中心，以及最先进的网络体系结构，具备保障全天候24小时不间断运行的能力。